'Kapitän Nauti und die Tochter des Wasserkönigs' folgt auf den ersten Teil 'Kapitän Nauti und die Suche nach dem richtigen Weg'. Timmi spielt mit seinem Boot am Badesee, als es im Schilf blubbert. Timmis Freude ist groß, als Kapitän Nautis Uboot auftaucht. Der Kater Kapitän Nauti hatte Timmi nämlich versprochen, ihm die aufregende Geschichte, wie er Neptuns erster und einziger Uboot-Kapitän wurde, zu erzählen.